Het fenomeen van de populatieknelpunt veroorzaakt een afname van de genenpools van populaties van organismen, parallel met een afname van allelen (genetische differentiatie). Het optreden van deze afname in genetische differentiatie is een groot gevaar voor de resterende populaties, omdat genetische differentiatie ervoor zorgt dat organismen zich kunnen aanpassen aan veranderingen in de omgeving om hen heen, zoals klimaatverandering of uitputting van beschikbare hulpbronnen, en dus zullen de populaties van organismen zeer gevoelig worden voor elke mutatie in zijn natuurlijke omgeving en zullen bij elke verandering ernstig met uitsterven worden bedreigd.
hee In De Flessenhals Zoek K Een Vissersplaats?
Na een knelpunt in de populatie ervaart de resterende populatie van een organisme een hoger niveau van genetische drift, wat een reeks willekeurige fluctuaties is in het niveau van allelen in de populatie. In kleine populaties hebben (zelden voorkomende) allelen een grotere kans om te verdwijnen, wat de aanwezigheid van genenpools verder beperkt. Als gevolg van het verlies van genetisch onderscheidend vermogen kan de nieuwe populatie genetisch onderscheiden worden van de oorspronkelijke populatie, en dit leidt op zijn beurt tot de hypothese dat het knelpunt in de populatie nieuwe soorten levende wezens kan voortbrengen.
Het meest voorkomende voorbeeld van een knelpunt in de populatie is wanneer een diersoort op de rand van uitsterven wordt gebracht, om vervolgens door ecologen opnieuw te worden geïntroduceerd. Zelfs als hervermeerdering erin slaagt het dier te redden, zullen zijn genen hun genetische onderscheid verliezen en zal het zeer gevoelig worden voor uitsterven zodra een ziekte of epidemie zich verspreidt of een kleine verandering in het klimaat optreedt. Dit probleem maakt het redden van bedreigde dieren erg moeilijk, omdat deze dieren ook na herintroductie bedreigd blijven. Voorbeelden zijn de Amerikaanse bizon, de noordelijke zeeolifant en andere dieren.